Развитие музея опирается на смешанную модель финансирования. Расширение экспозиций, благоустройство и модернизацию зоопарка планируется выполнить за счет бюджетных средств, включая единую дальневосточную субсидию, грантовые конкурсы и целевые программы. Коммерческие объекты, в их числе гастрономический, детский и ремесленный центры, предлагается реализовать через частные инвестиции на условиях долгосрочной аренды земли. Новая билетная система с раздельными и едиными билетами, абонементами и семейными тарифами способна увеличить поступления от продаж до 99 млн рублей в год. Для эксплуатации расширенной территории и работы с инвесторами создается отдельная управляющая компания. По расчетам, общий объем инвестиций в проект составляет 1 040 млн рублей (около 1 млрд рублей), до 20% которых может покрыть частный инвестор, а годовая посещаемость способна вырасти до 500 000 человек и дать более 30 новых рабочих мест.